Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP9Q99956 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP9Q99956 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms