Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms