Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD6Q96NE9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms