Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms