Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71F1Q96KD3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms