Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
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