Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHDQ96IW2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHDQ96IW2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHDQ96IW2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHDQ96IW2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHDQ96IW2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHDQ96IW2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHDQ96IW2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHDQ96IW2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHDQ96IW2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHDQ96IW2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHDQ96IW2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SHDQ96IW2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SHDQ96IW2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms