Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms