Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms