Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HGDQ93099 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HGDQ93099 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HGDQ93099 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HGDQ93099 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HGDQ93099 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HGDQ93099 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HGDQ93099 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HGDQ93099 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HGDQ93099 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HGDQ93099 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HGDQ93099 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HGDQ93099 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HGDQ93099 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HGDQ93099 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HGDQ93099 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HGDQ93099 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HGDQ93099 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HGDQ93099 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HGDQ93099 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HGDQ93099 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HGDQ93099 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HGDQ93099 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HGDQ93099 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms