Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
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PTPRUQ92729 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
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PTPRUQ92729 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
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PTPRUQ92729 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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PTPRUQ92729 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
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PTPRUQ92729 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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PTPRUQ92729 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRUQ92729 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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