Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms