Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAPGEF4Q8WZA2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAPGEF4Q8WZA2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms