Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms