Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms