Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms