Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms