Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms