Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSAMQ8N6F7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms