Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms