Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms