Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms