Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZD4Q76G19 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms