Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms