Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms