Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms