Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms