Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms