Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITRM1Q5JRX3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITRM1Q5JRX3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITRM1Q5JRX3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITRM1Q5JRX3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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