Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRT3Q5FWE3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms