Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms