Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms