Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms