Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms