Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HFEQ30201 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HFEQ30201 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HFEQ30201 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HFEQ30201 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HFEQ30201 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HFEQ30201 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HFEQ30201 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HFEQ30201 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HFEQ30201 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HFEQ30201 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HFEQ30201 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HFEQ30201 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HFEQ30201 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HFEQ30201 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HFEQ30201 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HFEQ30201 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HFEQ30201 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HFEQ30201 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HFEQ30201 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HFEQ30201 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HFEQ30201 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HFEQ30201 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HFEQ30201 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HFEQ30201 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HFEQ30201 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms