Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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