Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IMPG1Q17R60 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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