Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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