Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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HIF1AQ16665 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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