Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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