Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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E2F4Q16254 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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E2F4Q16254 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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E2F4Q16254 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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