Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA1Q15788 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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