Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms