Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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