Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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