Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PDCD1Q15116 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PDCD1Q15116 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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