Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms