Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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