Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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