Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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